Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms