Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDN3

Mylk, Myosin light chain kinase, smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MylkQ6PDN3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MylkQ6PDN3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MylkQ6PDN3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms