Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms