Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms