Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Uspl1Q3ULM6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Uspl1Q3ULM6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uspl1Q3ULM6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.9 ms