Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01666 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01666 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01666 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01666 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01666 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
P01666 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01666 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01666 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01666 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01666 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01666 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01666 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01666 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01666 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01666 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01666 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01666 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01666 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01666 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01666 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01666 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01666 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01666 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01666 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01666 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms