Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms