Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl27Q99N92 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms