Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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NipblQ6KCD5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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NipblQ6KCD5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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NipblQ6KCD5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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NipblQ6KCD5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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NipblQ6KCD5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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NipblQ6KCD5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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NipblQ6KCD5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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