Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Uspl1Q3ULM6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Uspl1Q3ULM6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Uspl1Q3ULM6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uspl1Q3ULM6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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