Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm2aP59997 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm2aP59997 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms