Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41P48193 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb41P48193 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms