Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5cP41230 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms