Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms