Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhoP15409 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RhoP15409 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhoP15409 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhoP15409 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms