Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prf1P10820 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prf1P10820 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms