Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms