Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna3O08545 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna3O08545 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna3O08545 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna3O08545 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna3O08545 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1050.4 ms