Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms