Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Edf1Q9JMG1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edf1Q9JMG1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edf1Q9JMG1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edf1Q9JMG1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Edf1Q9JMG1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edf1Q9JMG1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edf1Q9JMG1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edf1Q9JMG1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edf1Q9JMG1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edf1Q9JMG1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Edf1Q9JMG1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edf1Q9JMG1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edf1Q9JMG1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms