Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Irx6Q9ER75 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Irx6Q9ER75 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Irx6Q9ER75 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx6Q9ER75 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx6Q9ER75 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx6Q9ER75 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx6Q9ER75 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx6Q9ER75 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx6Q9ER75 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx6Q9ER75 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx6Q9ER75 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx6Q9ER75 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms