Protein–RNA interactions for Protein: Q8K215

Lyrm4, LYR motif-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm4Q8K215 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lyrm4Q8K215 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms