Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms