Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NclP09405 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NclP09405 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NclP09405 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NclP09405 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NclP09405 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NclP09405 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NclP09405 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NclP09405 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NclP09405 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NclP09405 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NclP09405 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NclP09405 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NclP09405 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NclP09405 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NclP09405 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NclP09405 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NclP09405 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NclP09405 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NclP09405 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NclP09405 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NclP09405 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NclP09405 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NclP09405 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NclP09405 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NclP09405 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NclP09405 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NclP09405 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NclP09405 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NclP09405 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NclP09405 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NclP09405 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NclP09405 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NclP09405 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NclP09405 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NclP09405 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NclP09405 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NclP09405 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NclP09405 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NclP09405 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NclP09405 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NclP09405 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NclP09405 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NclP09405 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NclP09405 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NclP09405 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NclP09405 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NclP09405 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NclP09405 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NclP09405 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NclP09405 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NclP09405 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NclP09405 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NclP09405 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NclP09405 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NclP09405 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NclP09405 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NclP09405 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NclP09405 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NclP09405 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NclP09405 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NclP09405 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NclP09405 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NclP09405 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NclP09405 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NclP09405 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NclP09405 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NclP09405 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NclP09405 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NclP09405 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NclP09405 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NclP09405 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NclP09405 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NclP09405 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NclP09405 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NclP09405 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NclP09405 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NclP09405 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NclP09405 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NclP09405 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NclP09405 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms