Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms