Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a3A2ACT7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a3A2ACT7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms