Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vstm4T1NXB5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vstm4T1NXB5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vstm4T1NXB5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vstm4T1NXB5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vstm4T1NXB5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vstm4T1NXB5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vstm4T1NXB5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vstm4T1NXB5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vstm4T1NXB5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vstm4T1NXB5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vstm4T1NXB5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vstm4T1NXB5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vstm4T1NXB5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vstm4T1NXB5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms