Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt27Q9Z320 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt27Q9Z320 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt27Q9Z320 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt27Q9Z320 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt27Q9Z320 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt27Q9Z320 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt27Q9Z320 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt27Q9Z320 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt27Q9Z320 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt27Q9Z320 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt27Q9Z320 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt27Q9Z320 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt27Q9Z320 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt27Q9Z320 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt27Q9Z320 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt27Q9Z320 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt27Q9Z320 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt27Q9Z320 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt27Q9Z320 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt27Q9Z320 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt27Q9Z320 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt27Q9Z320 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt27Q9Z320 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt27Q9Z320 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt27Q9Z320 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt27Q9Z320 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt27Q9Z320 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt27Q9Z320 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt27Q9Z320 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt27Q9Z320 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt27Q9Z320 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt27Q9Z320 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt27Q9Z320 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt27Q9Z320 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt27Q9Z320 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt27Q9Z320 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt27Q9Z320 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt27Q9Z320 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt27Q9Z320 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt27Q9Z320 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt27Q9Z320 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt27Q9Z320 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt27Q9Z320 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt27Q9Z320 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt27Q9Z320 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt27Q9Z320 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt27Q9Z320 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt27Q9Z320 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt27Q9Z320 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt27Q9Z320 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt27Q9Z320 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt27Q9Z320 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt27Q9Z320 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt27Q9Z320 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt27Q9Z320 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt27Q9Z320 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt27Q9Z320 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt27Q9Z320 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt27Q9Z320 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt27Q9Z320 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 593.4 ms