Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rps6ka4Q9Z2B9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rps6ka4Q9Z2B9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Rps6ka4Q9Z2B9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rps6ka4Q9Z2B9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rps6ka4Q9Z2B9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rps6ka4Q9Z2B9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rps6ka4Q9Z2B9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rps6ka4Q9Z2B9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rps6ka4Q9Z2B9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rps6ka4Q9Z2B9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rps6ka4Q9Z2B9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms