Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stk39Q9Z1W9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stk39Q9Z1W9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stk39Q9Z1W9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stk39Q9Z1W9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stk39Q9Z1W9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stk39Q9Z1W9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stk39Q9Z1W9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stk39Q9Z1W9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stk39Q9Z1W9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stk39Q9Z1W9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stk39Q9Z1W9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stk39Q9Z1W9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stk39Q9Z1W9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stk39Q9Z1W9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stk39Q9Z1W9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stk39Q9Z1W9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stk39Q9Z1W9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stk39Q9Z1W9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stk39Q9Z1W9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Stk39Q9Z1W9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stk39Q9Z1W9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stk39Q9Z1W9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stk39Q9Z1W9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stk39Q9Z1W9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stk39Q9Z1W9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stk39Q9Z1W9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stk39Q9Z1W9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stk39Q9Z1W9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stk39Q9Z1W9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Stk39Q9Z1W9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stk39Q9Z1W9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stk39Q9Z1W9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stk39Q9Z1W9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stk39Q9Z1W9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stk39Q9Z1W9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stk39Q9Z1W9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stk39Q9Z1W9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stk39Q9Z1W9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stk39Q9Z1W9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stk39Q9Z1W9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stk39Q9Z1W9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stk39Q9Z1W9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Stk39Q9Z1W9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Stk39Q9Z1W9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stk39Q9Z1W9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stk39Q9Z1W9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Stk39Q9Z1W9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stk39Q9Z1W9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stk39Q9Z1W9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Stk39Q9Z1W9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stk39Q9Z1W9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stk39Q9Z1W9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stk39Q9Z1W9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stk39Q9Z1W9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Stk39Q9Z1W9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stk39Q9Z1W9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stk39Q9Z1W9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stk39Q9Z1W9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stk39Q9Z1W9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stk39Q9Z1W9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stk39Q9Z1W9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stk39Q9Z1W9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stk39Q9Z1W9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms