Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R3

Apom, Apolipoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApomQ9Z1R3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApomQ9Z1R3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApomQ9Z1R3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApomQ9Z1R3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApomQ9Z1R3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApomQ9Z1R3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApomQ9Z1R3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApomQ9Z1R3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApomQ9Z1R3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ApomQ9Z1R3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ApomQ9Z1R3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApomQ9Z1R3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApomQ9Z1R3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms