Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngr4Q9Z1L2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngr4Q9Z1L2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngr4Q9Z1L2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngr4Q9Z1L2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngr4Q9Z1L2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngr4Q9Z1L2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngr4Q9Z1L2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngr4Q9Z1L2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngr4Q9Z1L2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngr4Q9Z1L2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngr4Q9Z1L2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngr4Q9Z1L2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syngr4Q9Z1L2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngr4Q9Z1L2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngr4Q9Z1L2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr4Q9Z1L2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms