Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVS6

Prkn, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrknQ9WVS6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrknQ9WVS6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrknQ9WVS6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrknQ9WVS6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrknQ9WVS6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms