Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nme3Q9WV85 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nme3Q9WV85 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme3Q9WV85 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme3Q9WV85 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme3Q9WV85 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme3Q9WV85 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nme3Q9WV85 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme3Q9WV85 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nme3Q9WV85 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nme3Q9WV85 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nme3Q9WV85 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nme3Q9WV85 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nme3Q9WV85 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nme3Q9WV85 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nme3Q9WV85 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nme3Q9WV85 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nme3Q9WV85 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nme3Q9WV85 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nme3Q9WV85 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nme3Q9WV85 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nme3Q9WV85 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nme3Q9WV85 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nme3Q9WV85 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nme3Q9WV85 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nme3Q9WV85 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nme3Q9WV85 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nme3Q9WV85 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nme3Q9WV85 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nme3Q9WV85 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nme3Q9WV85 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nme3Q9WV85 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nme3Q9WV85 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nme3Q9WV85 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nme3Q9WV85 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nme3Q9WV85 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nme3Q9WV85 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nme3Q9WV85 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nme3Q9WV85 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nme3Q9WV85 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms