Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp6ap1Q9R1Q9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp6ap1Q9R1Q9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp6ap1Q9R1Q9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp6ap1Q9R1Q9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp6ap1Q9R1Q9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp6ap1Q9R1Q9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp6ap1Q9R1Q9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp6ap1Q9R1Q9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp6ap1Q9R1Q9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp6ap1Q9R1Q9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6ap1Q9R1Q9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6ap1Q9R1Q9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6ap1Q9R1Q9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.3 ms