Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt71Q9R0H5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt71Q9R0H5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt71Q9R0H5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt71Q9R0H5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt71Q9R0H5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt71Q9R0H5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt71Q9R0H5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt71Q9R0H5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt71Q9R0H5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt71Q9R0H5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt71Q9R0H5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt71Q9R0H5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt71Q9R0H5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt71Q9R0H5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt71Q9R0H5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt71Q9R0H5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt71Q9R0H5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt71Q9R0H5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt71Q9R0H5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt71Q9R0H5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt71Q9R0H5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt71Q9R0H5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt71Q9R0H5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt71Q9R0H5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt71Q9R0H5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt71Q9R0H5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt71Q9R0H5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt71Q9R0H5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms