Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Lamc3Q9R0B6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Lamc3Q9R0B6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
Lamc3Q9R0B6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Lamc3Q9R0B6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Lamc3Q9R0B6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Lamc3Q9R0B6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Lamc3Q9R0B6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Lamc3Q9R0B6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Lamc3Q9R0B6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Lamc3Q9R0B6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Lamc3Q9R0B6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Lamc3Q9R0B6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Lamc3Q9R0B6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Lamc3Q9R0B6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
Lamc3Q9R0B6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Lamc3Q9R0B6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Lamc3Q9R0B6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
Lamc3Q9R0B6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
Lamc3Q9R0B6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Lamc3Q9R0B6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Lamc3Q9R0B6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Lamc3Q9R0B6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Lamc3Q9R0B6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Lamc3Q9R0B6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Lamc3Q9R0B6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Lamc3Q9R0B6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Lamc3Q9R0B6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Lamc3Q9R0B6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Lamc3Q9R0B6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Lamc3Q9R0B6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Lamc3Q9R0B6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Lamc3Q9R0B6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Lamc3Q9R0B6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Lamc3Q9R0B6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Lamc3Q9R0B6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Lamc3Q9R0B6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Lamc3Q9R0B6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Lamc3Q9R0B6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Lamc3Q9R0B6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Lamc3Q9R0B6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
Lamc3Q9R0B6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
Lamc3Q9R0B6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
Lamc3Q9R0B6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Lamc3Q9R0B6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Lamc3Q9R0B6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Lamc3Q9R0B6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Lamc3Q9R0B6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Lamc3Q9R0B6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Lamc3Q9R0B6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Lamc3Q9R0B6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Lamc3Q9R0B6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
Lamc3Q9R0B6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Lamc3Q9R0B6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Lamc3Q9R0B6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Lamc3Q9R0B6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Lamc3Q9R0B6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Lamc3Q9R0B6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
Lamc3Q9R0B6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Lamc3Q9R0B6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Lamc3Q9R0B6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Lamc3Q9R0B6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Lamc3Q9R0B6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Lamc3Q9R0B6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Lamc3Q9R0B6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Lamc3Q9R0B6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Lamc3Q9R0B6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Lamc3Q9R0B6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Lamc3Q9R0B6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Lamc3Q9R0B6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Lamc3Q9R0B6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Lamc3Q9R0B6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Lamc3Q9R0B6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Lamc3Q9R0B6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Lamc3Q9R0B6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Lamc3Q9R0B6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Lamc3Q9R0B6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Lamc3Q9R0B6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Lamc3Q9R0B6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Lamc3Q9R0B6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Lamc3Q9R0B6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Lamc3Q9R0B6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Lamc3Q9R0B6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
Lamc3Q9R0B6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Lamc3Q9R0B6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Lamc3Q9R0B6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Lamc3Q9R0B6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Lamc3Q9R0B6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Lamc3Q9R0B6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC40.05■■■■■ 4
Lamc3Q9R0B6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Lamc3Q9R0B6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Lamc3Q9R0B6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Lamc3Q9R0B6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Lamc3Q9R0B6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Lamc3Q9R0B6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Lamc3Q9R0B6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Lamc3Q9R0B6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms