Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp11cQ9QZW0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp11cQ9QZW0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp11cQ9QZW0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp11cQ9QZW0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp11cQ9QZW0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp11cQ9QZW0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp11cQ9QZW0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp11cQ9QZW0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp11cQ9QZW0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp11cQ9QZW0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp11cQ9QZW0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp11cQ9QZW0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp11cQ9QZW0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp11cQ9QZW0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp11cQ9QZW0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp11cQ9QZW0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp11cQ9QZW0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp11cQ9QZW0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp11cQ9QZW0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp11cQ9QZW0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp11cQ9QZW0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11cQ9QZW0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11cQ9QZW0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11cQ9QZW0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11cQ9QZW0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp11cQ9QZW0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp11cQ9QZW0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp11cQ9QZW0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms