Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nphp1Q9QY53 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nphp1Q9QY53 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nphp1Q9QY53 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nphp1Q9QY53 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nphp1Q9QY53 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nphp1Q9QY53 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nphp1Q9QY53 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nphp1Q9QY53 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nphp1Q9QY53 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nphp1Q9QY53 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nphp1Q9QY53 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nphp1Q9QY53 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nphp1Q9QY53 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nphp1Q9QY53 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nphp1Q9QY53 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nphp1Q9QY53 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nphp1Q9QY53 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nphp1Q9QY53 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nphp1Q9QY53 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nphp1Q9QY53 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nphp1Q9QY53 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nphp1Q9QY53 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nphp1Q9QY53 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nphp1Q9QY53 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nphp1Q9QY53 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Nphp1Q9QY53 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nphp1Q9QY53 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nphp1Q9QY53 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nphp1Q9QY53 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nphp1Q9QY53 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nphp1Q9QY53 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nphp1Q9QY53 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nphp1Q9QY53 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Nphp1Q9QY53 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Nphp1Q9QY53 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nphp1Q9QY53 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nphp1Q9QY53 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nphp1Q9QY53 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nphp1Q9QY53 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nphp1Q9QY53 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nphp1Q9QY53 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nphp1Q9QY53 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nphp1Q9QY53 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nphp1Q9QY53 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nphp1Q9QY53 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Nphp1Q9QY53 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Nphp1Q9QY53 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nphp1Q9QY53 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nphp1Q9QY53 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nphp1Q9QY53 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nphp1Q9QY53 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nphp1Q9QY53 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nphp1Q9QY53 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nphp1Q9QY53 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nphp1Q9QY53 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nphp1Q9QY53 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms