Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cln8Q9QUK3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cln8Q9QUK3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cln8Q9QUK3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cln8Q9QUK3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cln8Q9QUK3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cln8Q9QUK3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cln8Q9QUK3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cln8Q9QUK3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cln8Q9QUK3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cln8Q9QUK3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cln8Q9QUK3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cln8Q9QUK3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cln8Q9QUK3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cln8Q9QUK3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cln8Q9QUK3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cln8Q9QUK3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cln8Q9QUK3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cln8Q9QUK3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cln8Q9QUK3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cln8Q9QUK3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cln8Q9QUK3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cln8Q9QUK3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cln8Q9QUK3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cln8Q9QUK3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cln8Q9QUK3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cln8Q9QUK3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cln8Q9QUK3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cln8Q9QUK3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms