Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdc42ep4Q9JM96 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdc42ep4Q9JM96 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdc42ep4Q9JM96 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdc42ep4Q9JM96 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdc42ep4Q9JM96 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdc42ep4Q9JM96 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdc42ep4Q9JM96 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdc42ep4Q9JM96 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdc42ep4Q9JM96 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdc42ep4Q9JM96 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdc42ep4Q9JM96 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdc42ep4Q9JM96 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdc42ep4Q9JM96 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdc42ep4Q9JM96 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdc42ep4Q9JM96 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdc42ep4Q9JM96 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc42ep4Q9JM96 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc42ep4Q9JM96 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdc42ep4Q9JM96 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdc42ep4Q9JM96 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdc42ep4Q9JM96 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdc42ep4Q9JM96 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdc42ep4Q9JM96 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42ep4Q9JM96 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42ep4Q9JM96 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42ep4Q9JM96 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42ep4Q9JM96 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42ep4Q9JM96 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdc42ep4Q9JM96 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdc42ep4Q9JM96 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdc42ep4Q9JM96 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms