Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtsmQ9JL96 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsmQ9JL96 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsmQ9JL96 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsmQ9JL96 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsmQ9JL96 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsmQ9JL96 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtsmQ9JL96 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtsmQ9JL96 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtsmQ9JL96 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CtsmQ9JL96 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtsmQ9JL96 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtsmQ9JL96 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtsmQ9JL96 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtsmQ9JL96 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtsmQ9JL96 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtsmQ9JL96 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtsmQ9JL96 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtsmQ9JL96 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtsmQ9JL96 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtsmQ9JL96 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtsmQ9JL96 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtsmQ9JL96 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtsmQ9JL96 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtsmQ9JL96 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtsmQ9JL96 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtsmQ9JL96 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtsmQ9JL96 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtsmQ9JL96 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CtsmQ9JL96 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtsmQ9JL96 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtsmQ9JL96 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtsmQ9JL96 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtsmQ9JL96 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtsmQ9JL96 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtsmQ9JL96 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtsmQ9JL96 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CtsmQ9JL96 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtsmQ9JL96 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtsmQ9JL96 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CtsmQ9JL96 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms