Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

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Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Aff4Q9ESC8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aff4Q9ESC8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aff4Q9ESC8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aff4Q9ESC8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aff4Q9ESC8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aff4Q9ESC8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aff4Q9ESC8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aff4Q9ESC8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aff4Q9ESC8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aff4Q9ESC8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aff4Q9ESC8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aff4Q9ESC8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aff4Q9ESC8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aff4Q9ESC8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aff4Q9ESC8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aff4Q9ESC8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff4Q9ESC8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Aff4Q9ESC8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aff4Q9ESC8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aff4Q9ESC8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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