Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SelenofQ9ERR7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenofQ9ERR7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SelenofQ9ERR7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SelenofQ9ERR7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms