Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG2

Strn3, Striatin-3, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn3Q9ERG2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strn3Q9ERG2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strn3Q9ERG2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strn3Q9ERG2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strn3Q9ERG2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strn3Q9ERG2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strn3Q9ERG2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strn3Q9ERG2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strn3Q9ERG2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn3Q9ERG2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn3Q9ERG2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn3Q9ERG2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn3Q9ERG2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn3Q9ERG2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strn3Q9ERG2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Strn3Q9ERG2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strn3Q9ERG2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strn3Q9ERG2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strn3Q9ERG2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strn3Q9ERG2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strn3Q9ERG2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strn3Q9ERG2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strn3Q9ERG2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn3Q9ERG2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn3Q9ERG2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn3Q9ERG2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strn3Q9ERG2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strn3Q9ERG2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Strn3Q9ERG2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strn3Q9ERG2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strn3Q9ERG2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms