Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpr88Q9EPB7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpr88Q9EPB7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpr88Q9EPB7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpr88Q9EPB7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpr88Q9EPB7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpr88Q9EPB7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpr88Q9EPB7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpr88Q9EPB7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpr88Q9EPB7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpr88Q9EPB7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpr88Q9EPB7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpr88Q9EPB7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpr88Q9EPB7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpr88Q9EPB7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gpr88Q9EPB7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpr88Q9EPB7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpr88Q9EPB7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpr88Q9EPB7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpr88Q9EPB7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpr88Q9EPB7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpr88Q9EPB7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpr88Q9EPB7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpr88Q9EPB7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpr88Q9EPB7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr88Q9EPB7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr88Q9EPB7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr88Q9EPB7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gpr88Q9EPB7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gpr88Q9EPB7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpr88Q9EPB7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpr88Q9EPB7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpr88Q9EPB7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpr88Q9EPB7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpr88Q9EPB7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpr88Q9EPB7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpr88Q9EPB7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpr88Q9EPB7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpr88Q9EPB7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpr88Q9EPB7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpr88Q9EPB7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms