Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Riok3Q9DBU3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Riok3Q9DBU3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Riok3Q9DBU3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms