Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU9

Znf654, Zinc finger protein 654, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf654Q9DAU9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znf654Q9DAU9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf654Q9DAU9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf654Q9DAU9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf654Q9DAU9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf654Q9DAU9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf654Q9DAU9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf654Q9DAU9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf654Q9DAU9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf654Q9DAU9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf654Q9DAU9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf654Q9DAU9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf654Q9DAU9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf654Q9DAU9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf654Q9DAU9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf654Q9DAU9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf654Q9DAU9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf654Q9DAU9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf654Q9DAU9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf654Q9DAU9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf654Q9DAU9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf654Q9DAU9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf654Q9DAU9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf654Q9DAU9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf654Q9DAU9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf654Q9DAU9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf654Q9DAU9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf654Q9DAU9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf654Q9DAU9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf654Q9DAU9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf654Q9DAU9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Znf654Q9DAU9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf654Q9DAU9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf654Q9DAU9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms