Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAN9

Uncharacterized protein C17orf105 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAN9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9DAN9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9DAN9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9DAN9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DAN9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DAN9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DAN9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DAN9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DAN9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DAN9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9DAN9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9DAN9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9DAN9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9DAN9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9DAN9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9DAN9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9DAN9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9DAN9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9DAN9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9DAN9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9DAN9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9DAN9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9DAN9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9DAN9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9DAN9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9DAN9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9DAN9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9DAN9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9DAN9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9DAN9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9DAN9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9DAN9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9DAN9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9DAN9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9DAN9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9DAN9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9DAN9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9DAN9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9DAN9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9DAN9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9DAN9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9DAN9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9DAN9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DAN9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DAN9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9DAN9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9DAN9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9DAN9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9DAN9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9DAN9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9DAN9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9DAN9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9DAN9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9DAN9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9DAN9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9DAN9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms