Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9DA42 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9DA42 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9DA42 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9DA42 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9DA42 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9DA42 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9DA42 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9DA42 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9DA42 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9DA42 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9DA42 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9DA42 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9DA42 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9DA42 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9DA42 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9DA42 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9DA42 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9DA42 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9DA42 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9DA42 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9DA42 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9DA42 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9DA42 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9DA42 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9DA42 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9DA42 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9DA42 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9DA42 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9DA42 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9DA42 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9DA42 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9DA42 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9DA42 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9DA42 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9DA42 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9DA42 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9DA42 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9DA42 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9DA42 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9DA42 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9DA42 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9DA42 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9DA42 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9DA42 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9DA42 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9DA42 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9DA42 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9DA42 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9DA42 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9DA42 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9DA42 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9DA42 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9DA42 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9DA42 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9DA42 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9DA42 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9DA42 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9DA42 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9DA42 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9DA42 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9DA42 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9DA42 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9DA42 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9DA42 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q9DA42 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q9DA42 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9DA42 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9DA42 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9DA42 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9DA42 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9DA42 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9DA42 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9DA42 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9DA42 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9DA42 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9DA42 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9DA42 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9DA42 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9DA42 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9DA42 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9DA42 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9DA42 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9DA42 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9DA42 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9DA42 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9DA42 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9DA42 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9DA42 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9DA42 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9DA42 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9DA42 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9DA42 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9DA42 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9DA42 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9DA42 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9DA42 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9DA42 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9DA42 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9DA42 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms